教会の運営は、奈良ブロック担当司牧者チームが招集する各小教区評議会が、教会の運営活動全般に関わる事柄について審議し、決定します。
「小教区評議会」は、以下の評議員によって構成されます。

・信徒の代表として選出された役員(4~5名:役員代表・奈良地区協議会担当・北部ブロック会議担当・書記)
・各部会の代表者(6名)
・各女子奉献生活者の会の代表者(1名)
・地区委員の代表者(1名)
・滞日外国人の会の代表者(1名)

 小教区評議会は、原則として毎月1回(ただし、8月と1月は除く)会議を開催しています。