部会は、小教区評議会で決定された方針に従って活動する執行機関です。
奈良教会には、以下の部会があり、各部会がおのおのの役割を分担して、諸活動を推進しています。
| 教育部 | 女子奉献生活者等の協力による求道者の教育、日曜学校や青少年活動等の子ども・青年の信仰教育、さらに聖書勉強会や信徒生涯学習、黙想会等の信徒養成など、信徒の教育に関する活動を行う |
| 典礼部 | 聖体奉仕者・集会司式者の学習・活動調整とミサや秘跡の準備と奉仕のための典礼グループ（侍者・聖歌隊・オルガニスト・ミサ準備等）の調整を行う。また、結婚式や葬儀等の冠婚葬祭の準備の為の典礼グループ（先唱・オルガニスト・ミサ準備等）の調整を行う |
| 広報部 | 教会会報・公式ホームページの作成・編集、教会パンフレットの編集、教会の資料保管を行う |
| 施設管理部 | 教会敷地内の建物・施設等の管理、備品管理、掃除の計画と手配を行う |
| 財務部 | 教会維持費や献金の集計、年度予算の立案と教会会計の管理を行う |
| 行事部 | 評議会で決定された教会内の行事、協議会主催行事の企画・調整・統括などの手配を他の信徒と共に行う |